ImportError on Ubuntu 18.04

[cpiscos]

I installed pyarrow from conda-forge and I'm getting this error on import:

>>> import pyarrow
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/home/chris/miniconda3/envs/ai/lib/python3.6/site-packages/pyarrow/__init__.py", line 47, in <module>
    from pyarrow.lib import cpu_count, set_cpu_count
ImportError: /home/chris/miniconda3/envs/ai/lib/python3.6/site-packages/pyarrow/../../../libparquet.so.1: undefined symbol: _ZNK5boost16re_detail_10650131cpp_regex_traits_implementationIcE9transformEPKcS4_

[kszucs]

Duplicate of https://issues.apache.org/jira/browse/ARROW-2783

[xhochy]

This should be fixed now, please try to reinstall arrow-cpp, parquet-cpp and pyarrow from conda-forge.

[cpiscos]

Can confirmed it's fixed. Thank you!

[sephib]

Hi,
I'm still having the same problem.
I'm working on dask_yarn and need to read hdfs files. I have installed arrow-cpp 0.10.0 and parquet-cpp 1.5.0.pre, but when I try to import pyarrow I get the following error:

> ---------------------------------------------------------------------------
> ImportError                               Traceback (most recent call last)
> <ipython-input-2-852643f3aad4> in <module>()
> ----> 1 import pyarrow as pa
> 
> ~/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/pyarrow/__init__.py in <module>()
>      58 
>      59 
> ---> 60 from pyarrow.lib import cpu_count, set_cpu_count
>      61 from pyarrow.lib import (null, bool_,
>      62                          int8, int16, int32, int64,
> 
> ImportError: /home/fcuser/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/pyarrow/../../../libparquet.so.1: undefined symbol: _ZN5boost13match_resultsIN9__gnu_cxx17__normal_iteratorIPKcSsEESaINS_9sub_matchIS5_EEEE12maybe_assignERKS9_
> 

I reinstalled the the packages put I'm still getting the same error
conda install --offline -f arrow-cpp-0.10.0-py36h70250a7_0.tar.bz2 parquet-cpp-1.5.0.pre-h83d4a3d_0.tar.bz2

Any suggestions?

[xhochy]

@sephib As in the comment above, it seems that you have installed boost from defaults but pyarrow from conda-forge. Please either install all these packages from defaults or all from conda-forge. Due to one not yet having done the compiler migration, they're incompatible.

[sephib]

Hi,
Thank you very much for your reply and solution
I updated all the packages to be from conda-forge and it workes now.
Thx

[rstuckey]

This is really frustrating. I'm getting the same error as @cpiscos , but cannot reinstall libboost from conda-forge (does it even exist on that channel?).

(testenv) $ conda install --channel conda-forge boost boost-cpp libboost pyarrow
Solving environment: done

## Package Plan ##

  environment location: /opt/anaconda3/envs/testenv

  added / updated specs: 
    - boost
    - boost-cpp
    - libboost
    - pyarrow


The following NEW packages will be INSTALLED:

    arrow-cpp: 0.11.0-py36hccec0d8_0 conda-forge
    boost:     1.67.0-py36h3e44d54_0 conda-forge
    boost-cpp: 1.67.0-h3a22d5f_0     conda-forge
    libboost:  1.67.0-h46d08c1_4     defaults   
    pyarrow:   0.11.0-py36hfc679d8_0 conda-forge

Installing all but libboost results in the following error:

(testenv) $ python
Python 3.6.6 | packaged by conda-forge | (default, Oct 12 2018, 14:08:43) 
[GCC 4.8.2 20140120 (Red Hat 4.8.2-15)] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import pyarrow
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/opt/anaconda3/envs/testenv/lib/python3.6/site-packages/pyarrow/__init__.py", line 54, in <module>
    from pyarrow.lib import cpu_count, set_cpu_count
ImportError: libboost_system.so.1.67.0: cannot open shared object file: No such file or directory
>>> 

Any advice would be appreciated.

[wesm]

Can you remove libboost? Having that and boost-cpp is going to cause you these problems

[rstuckey]

Hi @wesm, I tried that, but got the error above regarding libboost_system.so.1.67.0 in my test environment. Based on the error, I was under the mistaken impression that libboost was required. What did work was using the --override-channels flag, as well as omitting libboost, to restrict the channels to conda-forge (despite not having defaults in my .condarc). Thanks for your help :)

[rstuckey]

Argh. No, I spoke too soon: I still can't create the full environment (minus libboost) without getting the error. Here's the complete log:

$ /opt/anaconda3/bin/conda create --name testenv --channel bokeh --channel conda-forge \
--channel ioam --no-default-packages --override-channels python=3.6 arrow-cpp basemap \
basemap-data-hires beautifulsoup4 bitarray blaze bokeh boost bzip2 cairo cartopy cython \
dask datashader distributed fastparquet findspark flask geopy geos geoviews graphviz \
h5py hdf5 hdfs3 holoviews impyla ipython ipykernel ipywidgets jupyter jupyterhub lmfit \
matplotlib nbconvert netcdf4 nltk nose notebook numba numexpr numpy openpyxl pandas \
pathos pep8 pillow pip proj4 protobuf pyarrow pymc3 pyproj pyqt pyspark pytables pytest \
python-snappy pyyaml qt requests scikit-image scikit-learn scipy seaborn setuptools six \
sphinx spyder sqlalchemy sqlalchemy-utils statsmodels sudospawner sympy thriftpy tornado \
tqdm widgetsnbextension xarray zeromq
Solving environment: - done

## Package Plan ##

  environment location: /opt/anaconda3/envs/testenv

  added / updated specs: 
    - arrow-cpp
    - basemap
    - basemap-data-hires
    - beautifulsoup4
    - bitarray
    - blaze
    - bokeh
    - boost
    - bzip2
    - cairo
    - cartopy
    - cython
    - dask
    - datashader
    - distributed
    - fastparquet
    - findspark
    - flask
    - geopy
    - geos
    - geoviews
    - graphviz
    - h5py
    - hdf5
    - hdfs3
    - holoviews
    - impyla
    - ipykernel
    - ipython
    - ipywidgets
    - jupyter
    - jupyterhub
    - lmfit
    - matplotlib
    - nbconvert
    - netcdf4
    - nltk
    - nose
    - notebook
    - numba
    - numexpr
    - numpy
    - openpyxl
    - pandas
    - pathos
    - pep8
    - pillow
    - pip
    - proj4
    - protobuf
    - pyarrow
    - pymc3
    - pyproj
    - pyqt
    - pyspark
    - pytables
    - pytest
    - python-snappy
    - python=3.6
    - pyyaml
    - qt
    - requests
    - scikit-image
    - scikit-learn
    - scipy
    - seaborn
    - setuptools
    - six
    - sphinx
    - spyder
    - sqlalchemy
    - sqlalchemy-utils
    - statsmodels
    - sudospawner
    - sympy
    - thriftpy
    - tornado
    - tqdm
    - widgetsnbextension
    - xarray
    - zeromq


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    flask-1.0.2                |             py_2          66 KB  conda-forge
    pylint-2.1.1               |           py36_0         794 KB  conda-forge
    libgpg-error-1.32          |       hfc679d8_0         241 KB  conda-forge
    futures-compat-1.0         |            py3_0          313 B  conda-forge
    wrapt-1.10.11              |   py36h470a237_1          74 KB  conda-forge
    secretstorage-3.1.0        |        py36_1001          22 KB  conda-forge
    jsonschema-2.6.0           |        py36_1002          62 KB  conda-forge
    param-1.8.1                |             py_0          55 KB  conda-forge
    blas-1.1                   |         openblas           1 KB  conda-forge
    libssh2-1.8.0              |       h5b517e9_2         240 KB  conda-forge
    readline-7.0               |       haf1bffa_1         381 KB  conda-forge
    cloudpickle-0.6.1          |             py_0          16 KB  conda-forge
    geographiclib-1.49         |             py_0          32 KB  conda-forge
    h5py-2.8.0                 |   py36h7eb728f_3         3.7 MB  conda-forge
    flask-cors-3.0.6           |             py_0          13 KB  conda-forge
    pox-0.2.3                  |             py_1          18 KB  conda-forge
    beautifulsoup4-4.6.3       |        py36_1000         141 KB  conda-forge
    tk-8.6.8                   |       ha92aebf_0         3.1 MB  conda-forge
    bzip2-1.0.6                |       h470a237_2         310 KB  conda-forge
    jupyter_client-5.2.3       |             py_1          59 KB  conda-forge
    requests-2.19.1            |        py36_1001          95 KB  conda-forge
    numexpr-2.6.8              |   py36hf8a1672_0         424 KB  conda-forge
    statsmodels-0.9.0          |   py36h7eb728f_0        15.5 MB  conda-forge
    nltk-3.2.4                 |           py36_0         2.0 MB  conda-forge
    docutils-0.14              |        py36_1001         693 KB  conda-forge
    pillow-5.3.0               |   py36hc736899_0        1018 KB  conda-forge
    pymc3-3.5                  |           py36_0         1.3 MB  conda-forge
    tqdm-4.26.0                |             py_0          36 KB  conda-forge
    libstdcxx-ng-7.2.0         |       hdf63c60_3         2.5 MB  conda-forge
    blosc-1.14.4               |       hfc679d8_0         653 KB  conda-forge
    libtool-2.4.6              |       h470a237_2         517 KB  conda-forge
    libhdfs3-2.3               |                3         8.6 MB  conda-forge
    send2trash-1.5.0           |             py_0          12 KB  conda-forge
    xorg-libxt-1.1.5           |       h470a237_2         352 KB  conda-forge
    configurable-http-proxy-3.1.0|          node8_1         247 KB  conda-forge
    numpy-1.15.2               |py36_blas_openblashd3ea46f_1         9.3 MB  conda-forge
    simplegeneric-0.8.1        |             py_1           7 KB  conda-forge
    prometheus_client-0.4.2    |             py_0          32 KB  conda-forge
    fastcache-1.0.2            |   py36h470a237_1          48 KB  conda-forge
    pyzmq-17.1.2               |   py36hae99301_1         1.0 MB  conda-forge
    wcwidth-0.1.7              |             py_1          17 KB  conda-forge
    traitlets-4.3.2            |        py36_1000         131 KB  conda-forge
    ipywidgets-7.4.2           |             py_0          92 KB  conda-forge
    ipykernel-5.1.0            |     pyh24bf2e0_0          77 KB  conda-forge
    alabaster-0.7.12           |             py_0          15 KB  conda-forge
    libffi-3.2.1               |       hfc679d8_5          51 KB  conda-forge
    proj4-4.9.3                |       h470a237_8         3.2 MB  conda-forge
    lmfit-0.9.11               |     pyh24bf2e0_1          65 KB  conda-forge
    wheel-0.32.1               |           py36_0          34 KB  conda-forge
    python-dateutil-2.7.3      |             py_0         202 KB  conda-forge
    olefile-0.46               |             py_0          31 KB  conda-forge
    scipy-1.1.0                |py36_blas_openblash7943236_201        40.3 MB  conda-forge
    packaging-18.0             |             py_0          19 KB  conda-forge
    click-7.0                  |             py_0          61 KB  conda-forge
    dask-core-0.19.4           |             py_0         505 KB  conda-forge
    hdf5-1.10.2                |       hc401514_2         4.8 MB  conda-forge
    boost-1.66.0               |           py36_1         317 KB  conda-forge
    blaze-0.11.3               |           py36_0         603 KB  conda-forge
    xorg-libxpm-3.5.12         |       h470a237_2          56 KB  conda-forge
    defusedxml-0.5.0           |             py_1          20 KB  conda-forge
    asn1crypto-0.24.0          |        py36_1003         154 KB  conda-forge
    pywavelets-1.0.1           |   py36h7eb728f_0         6.1 MB  conda-forge
    matplotlib-base-3.0.0      |   py36hc039c98_2         9.4 MB  conda-forge
    cartopy-0.16.0             |   py36h81b52dc_2         2.3 MB  conda-forge
    libxml2-2.9.8              |       h422b904_5         1.8 MB  conda-forge
    python-3.6.6               |       h5001a0f_3        20.5 MB  conda-forge
    gmpy2-2.0.8                |   py36hb705a9b_2         624 KB  conda-forge
    patsy-0.5.0                |             py_1         184 KB  conda-forge
    more-itertools-4.3.0       |        py36_1000          83 KB  conda-forge
    ncurses-6.1                |       hfc679d8_1         1.2 MB  conda-forge
    distributed-1.23.3         |        py36_1000         812 KB  conda-forge
    libiconv-1.15              |       h470a237_3         2.0 MB  conda-forge
    xorg-libxdmcp-1.1.2        |       h470a237_7          17 KB  conda-forge
    sphinxcontrib-websupport-1.1.0|             py_1          20 KB  conda-forge
    entrypoints-0.2.3          |        py36_1002           9 KB  conda-forge
    pygpu-0.7.6                |   py36h7eb728f_0         1.4 MB  conda-forge
    pyspark-2.3.1              |        py36_1001       202.0 MB  conda-forge
    mpmath-1.0.0               |             py_1         430 KB  conda-forge
    partd-0.3.9                |             py_0          16 KB  conda-forge
    datashape-0.5.4            |           py36_0          98 KB  conda-forge
    setuptools-40.4.3          |           py36_0         554 KB  conda-forge
    libgcc-7.2.0               |       h69d50b8_2         304 KB  conda-forge
    pyparsing-2.2.2            |             py_0          51 KB  conda-forge
    tblib-1.3.2                |             py_1          11 KB  conda-forge
    pyproj-1.9.5.1             |   py36h508ed2a_5         134 KB  conda-forge
    pandoc-1.19.2              |                0        17.8 MB  conda-forge
    pyct-0.4.5                 |             py_0           2 KB  conda-forge
    notebook-5.7.0             |        py36_1000         7.3 MB  conda-forge
    hdfs3-0.3.0                |           py36_0          38 KB  conda-forge
    toolz-0.9.0                |             py_1          42 KB  conda-forge
    xorg-xextproto-7.3.0       |       h470a237_2          26 KB  conda-forge
    terminado-0.8.1            |        py36_1001          23 KB  conda-forge
    idna-2.7                   |        py36_1002         131 KB  conda-forge
    multiprocess-0.70.6.1      |        py36_1000         163 KB  conda-forge
    xorg-libice-1.0.9          |       h470a237_4          55 KB  conda-forge
    qtconsole-4.4.2            |             py_1          80 KB  conda-forge
    fontconfig-2.13.1          |       h65d0f4c_0         320 KB  conda-forge
    netcdf4-1.4.1              |   py36h62672b6_0         2.0 MB  conda-forge
    pyflakes-2.0.0             |             py_0          41 KB  conda-forge
    qt-5.6.2                   |       hf70d934_9        44.3 MB  conda-forge
    networkx-2.2               |             py_1         1.1 MB  conda-forge
    basemap-data-hires-1.2.0   |                0       105.4 MB  conda-forge
    expat-2.2.5                |       hfc679d8_2         144 KB  conda-forge
    libntlm-1.4                |       h470a237_1          31 KB  conda-forge
    libprotobuf-3.5.2          |       hd28b015_1         4.5 MB  conda-forge
    openpyxl-2.5.8             |             py_0         151 KB  conda-forge
    cycler-0.10.0              |             py_1           8 KB  conda-forge
    xarray-0.10.9              |           py36_0         775 KB  conda-forge
    cryptography-2.3.1         |   py36hdffb7b8_0         960 KB  conda-forge
    jdcal-1.4                  |             py_1           8 KB  conda-forge
    alembic-0.9.9              |             py_0         104 KB  conda-forge
    atomicwrites-1.2.1         |             py_0           9 KB  conda-forge
    llvmlite-0.25.0            |   py36hd28b015_1        10.3 MB  conda-forge
    pyyaml-3.13                |   py36h470a237_1         460 KB  conda-forge
    cffi-1.11.5                |   py36h5e8e0c9_1         404 KB  conda-forge
    decorator-4.3.0            |             py_0          10 KB  conda-forge
    snappy-1.1.7               |       hfc679d8_2          35 KB  conda-forge
    pathos-0.2.1               |             py_2          40 KB  conda-forge
    mpfr-4.0.1                 |       h16a7912_0         602 KB  conda-forge
    pyepsg-0.3.2               |             py_1           9 KB  conda-forge
    pip-18.1                   |        py36_1000         1.8 MB  conda-forge
    scikit-learn-0.20.0        |py36_blas_openblasha84fab4_201        13.6 MB  conda-forge
    gettext-0.19.8.1           |       h5e8e0c9_1         3.5 MB  conda-forge
    zlib-1.2.11                |       h470a237_3          93 KB  conda-forge
    libtiff-4.0.9              |       he6b73bb_2         521 KB  conda-forge
    mccabe-0.6.1               |             py_1           8 KB  conda-forge
    xorg-libsm-1.2.3           |       h8c8a85c_0          24 KB  conda-forge
    parquet-cpp-1.4.0          |       h83d4a3d_1         1.3 MB  conda-forge
    pcre-8.41                  |       hfc679d8_3         243 KB  conda-forge
    glib-2.56.2                |       h464dc38_0         4.9 MB  conda-forge
    mistune-0.8.4              |   py36h470a237_0          53 KB  conda-forge
    ppft-1.6.4.7.1             |        py36_1000          35 KB  conda-forge
    basemap-1.2.0              |   py36h50ae964_0        15.4 MB  conda-forge
    sphinx-1.8.1               |        py36_1000         1.9 MB  conda-forge
    gmp-6.1.2                  |       hfc679d8_0         676 KB  conda-forge
    pysocks-1.6.8              |        py36_1002          22 KB  conda-forge
    ipython-7.0.1              |py36h24bf2e0_1000         1.1 MB  conda-forge
    sortedcontainers-2.0.5     |             py_0          24 KB  conda-forge
    heapdict-1.0.0             |        py36_1000           7 KB  conda-forge
    urllib3-1.23               |        py36_1001         152 KB  conda-forge
    numpydoc-0.8.0             |             py_1          21 KB  conda-forge
    bottleneck-1.2.1           |   py36h7eb728f_1         309 KB  conda-forge
    lzo-2.10                   |       h470a237_0         224 KB  conda-forge
    boost-cpp-1.66.0           |                1        18.8 MB  conda-forge
    libxslt-1.1.32             |       h88dbc4e_2         511 KB  conda-forge
    python-editor-1.0.3        |             py_0           8 KB  conda-forge
    typed-ast-1.1.0            |           py36_0         737 KB  conda-forge
    asteval-0.9.13             |     pyh24bf2e0_0          18 KB  conda-forge
    xorg-kbproto-1.0.7         |       h470a237_2          25 KB  conda-forge
    jedi-0.13.1                |        py36_1000         228 KB  conda-forge
    prompt_toolkit-2.0.6       |             py_0         218 KB  conda-forge
    protobuf-3.5.2             |   py36hd28b015_0         1.4 MB  conda-forge
    geos-3.6.2                 |       hfc679d8_3         3.2 MB  conda-forge
    qtawesome-0.5.1            |     pyh8a2030e_1         563 KB  conda-forge
    pep8-1.7.1                 |             py_0          30 KB  conda-forge
    mako-1.0.7                 |             py_1          57 KB  conda-forge
    theano-1.0.3               |           py36_0         3.7 MB  conda-forge
    libgcrypt-1.8.3            |       hfc679d8_0         577 KB  conda-forge
    msgpack-python-0.5.6       |   py36h2d50403_3         306 KB  conda-forge
    yaml-0.1.7                 |       h470a237_1          77 KB  conda-forge
    rope-0.10.7                |             py_1         113 KB  conda-forge
    cytoolz-0.9.0.1            |   py36h470a237_1         1.3 MB  conda-forge
    nose-1.3.7                 |        py36_1002         214 KB  conda-forge
    lazy-object-proxy-1.3.1    |   py36h470a237_0          56 KB  conda-forge
    spyder-kernels-0.2.6       |             py_1          37 KB  conda-forge
    attrs-18.2.0               |             py_0          30 KB  conda-forge
    dask-0.19.4                |             py_0           3 KB  conda-forge
    jeepney-0.4                |             py_0          19 KB  conda-forge
    kiwisolver-1.0.1           |   py36h2d50403_2         924 KB  conda-forge
    ca-certificates-2018.10.15 |       ha4d7672_0         135 KB  conda-forge
    odo-0.5.1                  |             py_1          86 KB  conda-forge
    scikit-image-0.14.1        |   py36hfc679d8_0        35.7 MB  conda-forge
    jinja2-2.10                |             py_1          89 KB  conda-forge
    geoviews-1.5.0             |             py_0         345 KB  conda-forge
    openblas-0.2.20            |                8        17.0 MB  conda-forge
    pixman-0.34.0              |       h470a237_3         1.2 MB  conda-forge
    libuuid-2.32.1             |       h470a237_2          24 KB  conda-forge
    openssl-1.0.2p             |       h470a237_1         3.1 MB  conda-forge
    lxml-4.2.5                 |   py36hc9114bc_0         6.0 MB  conda-forge
    pycparser-2.19             |             py_0          87 KB  conda-forge
    nbconvert-5.4.0            |                1         324 KB  conda-forge
    pandas-0.23.4              |   py36hf8a1672_0        27.8 MB  conda-forge
    cryptography-vectors-2.3.1 |        py36_1000        30.5 MB  conda-forge
    keyring-15.1.0             |           py36_0          44 KB  conda-forge
    pandocfilters-1.4.2        |             py_1           9 KB  conda-forge
    locket-0.2.0               |             py_2           6 KB  conda-forge
    markupsafe-1.0             |   py36h470a237_1          33 KB  conda-forge
    jupyter_core-4.4.0         |             py_0          44 KB  conda-forge
    hdf4-4.2.13                |       h951d187_2         970 KB  conda-forge
    holoviews-1.10.7           |             py_0         3.0 MB  conda-forge
    thriftpy-0.3.9             |   py36h470a237_1         604 KB  conda-forge
    ply-3.11                   |             py_1          44 KB  conda-forge
    gst-plugins-base-1.12.5    |       hde13a9d_0         2.7 MB  conda-forge
    astroid-2.0.3              |           py36_0         247 KB  conda-forge
    imageio-2.3.0              |             py_1         3.1 MB  conda-forge
    cftime-1.0.1               |   py36h7eb728f_1         1.0 MB  conda-forge
    pango-1.40.14              |       he752989_2         527 KB  conda-forge
    pyqt-5.6.0                 |   py36h8210e8a_7         5.4 MB  conda-forge
    freetype-2.9.1             |       h6debe1e_4         800 KB  conda-forge
    pygments-2.2.0             |             py_1         622 KB  conda-forge
    spyder-3.3.1               |           py36_3         2.5 MB  conda-forge
    ipython_genutils-0.2.0     |             py_1          21 KB  conda-forge
    zict-0.1.3                 |             py_0          10 KB  conda-forge
    fastparquet-0.1.6          |           py36_0         285 KB  conda-forge
    thrift-0.11.0              |   py36hfc679d8_1         310 KB  conda-forge
    pluggy-0.8.0               |             py_0          17 KB  conda-forge
    isort-4.3.4                |        py36_1000          58 KB  conda-forge
    matplotlib-3.0.0           |                2           5 KB  conda-forge
    et_xmlfile-1.0.1           |           py36_0          19 KB  conda-forge
    libnetcdf-4.6.1            |       he6cff42_8         1.2 MB  conda-forge
    numba-0.40.0               |   py36hf8a1672_0         3.2 MB  conda-forge
    seaborn-0.9.0              |             py_0         159 KB  conda-forge
    xorg-libxau-1.0.8          |       h470a237_6          12 KB  conda-forge
    python-snappy-0.5.3        |   py36h00d4201_0          40 KB  conda-forge
    snowballstemmer-1.2.1      |             py_1          32 KB  conda-forge
    bleach-3.0.2               |             py_0         125 KB  conda-forge
    py-1.7.0                   |             py_0          65 KB  conda-forge
    icu-58.2                   |       hfc679d8_0        22.8 MB  conda-forge
    shapely-1.6.4              |   py36h164cb2d_1         749 KB  conda-forge
    libgcc-ng-7.2.0            |       hdf63c60_3         6.1 MB  conda-forge
    krb5-1.14.6                |                0         4.0 MB  conda-forge
    pytest-3.9.1               |        py36_1000         333 KB  conda-forge
    pyopenssl-18.0.0           |        py36_1000          80 KB  conda-forge
    libxcb-1.13                |       h470a237_2         393 KB  conda-forge
    werkzeug-0.14.1            |             py_0         249 KB  conda-forge
    pyviz_comms-0.6.0          |             py_0          11 KB  conda-forge
    xorg-libx11-1.6.6          |       h470a237_0         890 KB  conda-forge
    jupyter_console-6.0.0      |             py_0          19 KB  conda-forge
    jupyterhub-0.8.1           |           py36_0         1.6 MB  conda-forge
    sip-4.18.1                 |   py36hfc679d8_0         266 KB  conda-forge
    webencodings-0.5.1         |             py_1          12 KB  conda-forge
    ptyprocess-0.6.0           |        py36_1000          22 KB  conda-forge
    nodejs-8.10.0              |                0        14.9 MB  conda-forge
    tornado-5.1.1              |   py36h470a237_0         669 KB  conda-forge
    multipledispatch-0.6.0     |             py_0          12 KB  conda-forge
    bokeh-0.13.0               |     pyhed0053b_0         5.8 MB  bokeh
    libgpuarray-0.7.6          |       h470a237_3         240 KB  conda-forge
    pyarrow-0.9.0              |   py36hfc679d8_2         1.2 MB  conda-forge
    impyla-0.14.1              |           py36_0          88 KB  conda-forge
    datashader-0.6.8           |             py_0        10.8 MB  conda-forge
    libgfortran-3.0.0          |                1         281 KB  conda-forge
    cython-0.29                |   py36hfc679d8_0         4.9 MB  conda-forge
    py4j-0.10.7                |             py_1         177 KB  conda-forge
    sympy-1.3                  |        py36_1000         9.4 MB  conda-forge
    pycodestyle-2.4.0          |             py_1          34 KB  conda-forge
    xz-5.2.4                   |       h470a237_1         328 KB  conda-forge
    sqlite-3.25.2              |       hb1c47c0_0         1.6 MB  conda-forge
    arrow-cpp-0.9.0            |   py36h1ae9da6_7         4.2 MB  conda-forge
    harfbuzz-1.9.0             |       h04dbb29_1         1.1 MB  conda-forge
    pexpect-4.6.0              |        py36_1000          75 KB  conda-forge
    xorg-renderproto-0.11.1    |       h470a237_2           8 KB  conda-forge
    sqlalchemy-1.2.12          |   py36h470a237_0         1.6 MB  conda-forge
    dbus-1.13.0                |       h3a4f0e9_0         560 KB  conda-forge
    babel-2.6.0                |             py_1         5.6 MB  conda-forge
    testpath-0.4.2             |        py36_1000          91 KB  conda-forge
    xorg-libxext-1.3.3         |       h470a237_4          45 KB  conda-forge
    h5netcdf-0.6.2             |             py_0          15 KB  conda-forge
    widgetsnbextension-3.4.2   |        py36_1000         1.7 MB  conda-forge
    cairo-1.14.12              |       h276e583_5         1.3 MB  conda-forge
    qtpy-1.5.1                 |     pyh8a2030e_0          28 KB  conda-forge
    pyct-core-0.4.5            |             py_0          11 KB  conda-forge
    pytables-3.4.4             |   py36h4f72b40_1         8.3 MB  conda-forge
    pyshp-1.2.12               |             py_0          22 KB  conda-forge
    pamela-0.3.0               |          py_1001           8 KB  conda-forge
    owslib-0.17.0              |             py_0         117 KB  conda-forge
    bitarray-0.8.3             |   py36h470a237_0         113 KB  conda-forge
    parso-0.3.1                |             py_0          59 KB  conda-forge
    libpng-1.6.35              |       ha92aebf_2         305 KB  conda-forge
    pickleshare-0.7.5          |        py36_1000          12 KB  conda-forge
    graphviz-2.38.0            |       h08bfae6_9         9.7 MB  conda-forge
    sqlalchemy-utils-0.32.12   |           py36_0         104 KB  conda-forge
    jpeg-9c                    |       h470a237_1         229 KB  conda-forge
    imagesize-1.1.0            |             py_0           6 KB  conda-forge
    joblib-0.12.5              |             py_0         176 KB  conda-forge
    jupyter-1.0.0              |             py_1           6 KB  conda-forge
    colorcet-1.0.0             |             py_0         109 KB  conda-forge
    curl-7.61.0                |       h93b3f91_2         859 KB  conda-forge
    gstreamer-1.12.5           |       h5856ed1_0         2.1 MB  conda-forge
    libgsasl-1.8.0             |       h769c1d9_3         125 KB  conda-forge
    itsdangerous-0.24          |             py_2          12 KB  conda-forge
    chardet-3.0.4              |        py36_1003         190 KB  conda-forge
    psutil-5.4.7               |   py36h470a237_1         333 KB  conda-forge
    uncertainties-3.0.2        |        py36_1001         117 KB  conda-forge
    pytz-2018.5                |             py_0         193 KB  conda-forge
    sudospawner-0.5.2          |           py36_0          13 KB  conda-forge
    libsodium-1.0.16           |       h470a237_1         536 KB  conda-forge
    xorg-libxrender-0.9.10     |       h470a237_2          28 KB  conda-forge
    nbformat-4.4.0             |             py_1          91 KB  conda-forge
    dill-0.2.8.2               |        py36_1000         111 KB  conda-forge
    mpc-1.1.0                  |       hb705a9b_6         125 KB  conda-forge
    findspark-1.3.0            |             py_1           6 KB  conda-forge
    python-oauth2-1.0.1        |           py36_0          86 KB  conda-forge
    geopy-1.17.0               |             py_0          49 KB  conda-forge
    certifi-2018.10.15         |        py36_1000         138 KB  conda-forge
    six-1.11.0                 |        py36_1001          21 KB  conda-forge
    zeromq-4.2.5               |       hfc679d8_6         939 KB  conda-forge
    backcall-0.1.0             |             py_0          13 KB  conda-forge
    graphite2-1.3.12           |       hfc679d8_1         104 KB  conda-forge
    xorg-xproto-7.0.31         |       h470a237_7          72 KB  conda-forge
    pthread-stubs-0.4          |       h470a237_1           5 KB  conda-forge
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:       909.4 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

    alabaster:                0.7.12-py_0                           conda-forge
    alembic:                  0.9.9-py_0                            conda-forge
    arrow-cpp:                0.9.0-py36h1ae9da6_7                  conda-forge
    asn1crypto:               0.24.0-py36_1003                      conda-forge
    asteval:                  0.9.13-pyh24bf2e0_0                   conda-forge
    astroid:                  2.0.3-py36_0                          conda-forge
    atomicwrites:             1.2.1-py_0                            conda-forge
    attrs:                    18.2.0-py_0                           conda-forge
    babel:                    2.6.0-py_1                            conda-forge
    backcall:                 0.1.0-py_0                            conda-forge
    basemap:                  1.2.0-py36h50ae964_0                  conda-forge
    basemap-data-hires:       1.2.0-0                               conda-forge
    beautifulsoup4:           4.6.3-py36_1000                       conda-forge
    bitarray:                 0.8.3-py36h470a237_0                  conda-forge
    blas:                     1.1-openblas                          conda-forge
    blaze:                    0.11.3-py36_0                         conda-forge
    bleach:                   3.0.2-py_0                            conda-forge
    blosc:                    1.14.4-hfc679d8_0                     conda-forge
    bokeh:                    0.13.0-pyhed0053b_0                   bokeh      
    boost:                    1.66.0-py36_1                         conda-forge
    boost-cpp:                1.66.0-1                              conda-forge
    bottleneck:               1.2.1-py36h7eb728f_1                  conda-forge
    bzip2:                    1.0.6-h470a237_2                      conda-forge
    ca-certificates:          2018.10.15-ha4d7672_0                 conda-forge
    cairo:                    1.14.12-h276e583_5                    conda-forge
    cartopy:                  0.16.0-py36h81b52dc_2                 conda-forge
    certifi:                  2018.10.15-py36_1000                  conda-forge
    cffi:                     1.11.5-py36h5e8e0c9_1                 conda-forge
    cftime:                   1.0.1-py36h7eb728f_1                  conda-forge
    chardet:                  3.0.4-py36_1003                       conda-forge
    click:                    7.0-py_0                              conda-forge
    cloudpickle:              0.6.1-py_0                            conda-forge
    colorcet:                 1.0.0-py_0                            conda-forge
    configurable-http-proxy:  3.1.0-node8_1                         conda-forge
    cryptography:             2.3.1-py36hdffb7b8_0                  conda-forge
    cryptography-vectors:     2.3.1-py36_1000                       conda-forge
    curl:                     7.61.0-h93b3f91_2                     conda-forge
    cycler:                   0.10.0-py_1                           conda-forge
    cython:                   0.29-py36hfc679d8_0                   conda-forge
    cytoolz:                  0.9.0.1-py36h470a237_1                conda-forge
    dask:                     0.19.4-py_0                           conda-forge
    dask-core:                0.19.4-py_0                           conda-forge
    datashader:               0.6.8-py_0                            conda-forge
    datashape:                0.5.4-py36_0                          conda-forge
    dbus:                     1.13.0-h3a4f0e9_0                     conda-forge
    decorator:                4.3.0-py_0                            conda-forge
    defusedxml:               0.5.0-py_1                            conda-forge
    dill:                     0.2.8.2-py36_1000                     conda-forge
    distributed:              1.23.3-py36_1000                      conda-forge
    docutils:                 0.14-py36_1001                        conda-forge
    entrypoints:              0.2.3-py36_1002                       conda-forge
    et_xmlfile:               1.0.1-py36_0                          conda-forge
    expat:                    2.2.5-hfc679d8_2                      conda-forge
    fastcache:                1.0.2-py36h470a237_1                  conda-forge
    fastparquet:              0.1.6-py36_0                          conda-forge
    findspark:                1.3.0-py_1                            conda-forge
    flask:                    1.0.2-py_2                            conda-forge
    flask-cors:               3.0.6-py_0                            conda-forge
    fontconfig:               2.13.1-h65d0f4c_0                     conda-forge
    freetype:                 2.9.1-h6debe1e_4                      conda-forge
    futures-compat:           1.0-py3_0                             conda-forge
    geographiclib:            1.49-py_0                             conda-forge
    geopy:                    1.17.0-py_0                           conda-forge
    geos:                     3.6.2-hfc679d8_3                      conda-forge
    geoviews:                 1.5.0-py_0                            conda-forge
    gettext:                  0.19.8.1-h5e8e0c9_1                   conda-forge
    glib:                     2.56.2-h464dc38_0                     conda-forge
    gmp:                      6.1.2-hfc679d8_0                      conda-forge
    gmpy2:                    2.0.8-py36hb705a9b_2                  conda-forge
    graphite2:                1.3.12-hfc679d8_1                     conda-forge
    graphviz:                 2.38.0-h08bfae6_9                     conda-forge
    gst-plugins-base:         1.12.5-hde13a9d_0                     conda-forge
    gstreamer:                1.12.5-h5856ed1_0                     conda-forge
    h5netcdf:                 0.6.2-py_0                            conda-forge
    h5py:                     2.8.0-py36h7eb728f_3                  conda-forge
    harfbuzz:                 1.9.0-h04dbb29_1                      conda-forge
    hdf4:                     4.2.13-h951d187_2                     conda-forge
    hdf5:                     1.10.2-hc401514_2                     conda-forge
    hdfs3:                    0.3.0-py36_0                          conda-forge
    heapdict:                 1.0.0-py36_1000                       conda-forge
    holoviews:                1.10.7-py_0                           conda-forge
    icu:                      58.2-hfc679d8_0                       conda-forge
    idna:                     2.7-py36_1002                         conda-forge
    imageio:                  2.3.0-py_1                            conda-forge
    imagesize:                1.1.0-py_0                            conda-forge
    impyla:                   0.14.1-py36_0                         conda-forge
    ipykernel:                5.1.0-pyh24bf2e0_0                    conda-forge
    ipython:                  7.0.1-py36h24bf2e0_1000               conda-forge
    ipython_genutils:         0.2.0-py_1                            conda-forge
    ipywidgets:               7.4.2-py_0                            conda-forge
    isort:                    4.3.4-py36_1000                       conda-forge
    itsdangerous:             0.24-py_2                             conda-forge
    jdcal:                    1.4-py_1                              conda-forge
    jedi:                     0.13.1-py36_1000                      conda-forge
    jeepney:                  0.4-py_0                              conda-forge
    jinja2:                   2.10-py_1                             conda-forge
    joblib:                   0.12.5-py_0                           conda-forge
    jpeg:                     9c-h470a237_1                         conda-forge
    jsonschema:               2.6.0-py36_1002                       conda-forge
    jupyter:                  1.0.0-py_1                            conda-forge
    jupyter_client:           5.2.3-py_1                            conda-forge
    jupyter_console:          6.0.0-py_0                            conda-forge
    jupyter_core:             4.4.0-py_0                            conda-forge
    jupyterhub:               0.8.1-py36_0                          conda-forge
    keyring:                  15.1.0-py36_0                         conda-forge
    kiwisolver:               1.0.1-py36h2d50403_2                  conda-forge
    krb5:                     1.14.6-0                              conda-forge
    lazy-object-proxy:        1.3.1-py36h470a237_0                  conda-forge
    libffi:                   3.2.1-hfc679d8_5                      conda-forge
    libgcc:                   7.2.0-h69d50b8_2                      conda-forge
    libgcc-ng:                7.2.0-hdf63c60_3                      conda-forge
    libgcrypt:                1.8.3-hfc679d8_0                      conda-forge
    libgfortran:              3.0.0-1                               conda-forge
    libgpg-error:             1.32-hfc679d8_0                       conda-forge
    libgpuarray:              0.7.6-h470a237_3                      conda-forge
    libgsasl:                 1.8.0-h769c1d9_3                      conda-forge
    libhdfs3:                 2.3-3                                 conda-forge
    libiconv:                 1.15-h470a237_3                       conda-forge
    libnetcdf:                4.6.1-he6cff42_8                      conda-forge
    libntlm:                  1.4-h470a237_1                        conda-forge
    libpng:                   1.6.35-ha92aebf_2                     conda-forge
    libprotobuf:              3.5.2-hd28b015_1                      conda-forge
    libsodium:                1.0.16-h470a237_1                     conda-forge
    libssh2:                  1.8.0-h5b517e9_2                      conda-forge
    libstdcxx-ng:             7.2.0-hdf63c60_3                      conda-forge
    libtiff:                  4.0.9-he6b73bb_2                      conda-forge
    libtool:                  2.4.6-h470a237_2                      conda-forge
    libuuid:                  2.32.1-h470a237_2                     conda-forge
    libxcb:                   1.13-h470a237_2                       conda-forge
    libxml2:                  2.9.8-h422b904_5                      conda-forge
    libxslt:                  1.1.32-h88dbc4e_2                     conda-forge
    llvmlite:                 0.25.0-py36hd28b015_1                 conda-forge
    lmfit:                    0.9.11-pyh24bf2e0_1                   conda-forge
    locket:                   0.2.0-py_2                            conda-forge
    lxml:                     4.2.5-py36hc9114bc_0                  conda-forge
    lzo:                      2.10-h470a237_0                       conda-forge
    mako:                     1.0.7-py_1                            conda-forge
    markupsafe:               1.0-py36h470a237_1                    conda-forge
    matplotlib:               3.0.0-2                               conda-forge
    matplotlib-base:          3.0.0-py36hc039c98_2                  conda-forge
    mccabe:                   0.6.1-py_1                            conda-forge
    mistune:                  0.8.4-py36h470a237_0                  conda-forge
    more-itertools:           4.3.0-py36_1000                       conda-forge
    mpc:                      1.1.0-hb705a9b_6                      conda-forge
    mpfr:                     4.0.1-h16a7912_0                      conda-forge
    mpmath:                   1.0.0-py_1                            conda-forge
    msgpack-python:           0.5.6-py36h2d50403_3                  conda-forge
    multipledispatch:         0.6.0-py_0                            conda-forge
    multiprocess:             0.70.6.1-py36_1000                    conda-forge
    nbconvert:                5.4.0-1                               conda-forge
    nbformat:                 4.4.0-py_1                            conda-forge
    ncurses:                  6.1-hfc679d8_1                        conda-forge
    netcdf4:                  1.4.1-py36h62672b6_0                  conda-forge
    networkx:                 2.2-py_1                              conda-forge
    nltk:                     3.2.4-py36_0                          conda-forge
    nodejs:                   8.10.0-0                              conda-forge
    nose:                     1.3.7-py36_1002                       conda-forge
    notebook:                 5.7.0-py36_1000                       conda-forge
    numba:                    0.40.0-py36hf8a1672_0                 conda-forge
    numexpr:                  2.6.8-py36hf8a1672_0                  conda-forge
    numpy:                    1.15.2-py36_blas_openblashd3ea46f_1   conda-forge [blas_openblas]
    numpydoc:                 0.8.0-py_1                            conda-forge
    odo:                      0.5.1-py_1                            conda-forge
    olefile:                  0.46-py_0                             conda-forge
    openblas:                 0.2.20-8                              conda-forge
    openpyxl:                 2.5.8-py_0                            conda-forge
    openssl:                  1.0.2p-h470a237_1                     conda-forge
    owslib:                   0.17.0-py_0                           conda-forge
    packaging:                18.0-py_0                             conda-forge
    pamela:                   0.3.0-py_1001                         conda-forge
    pandas:                   0.23.4-py36hf8a1672_0                 conda-forge
    pandoc:                   1.19.2-0                              conda-forge
    pandocfilters:            1.4.2-py_1                            conda-forge
    pango:                    1.40.14-he752989_2                    conda-forge
    param:                    1.8.1-py_0                            conda-forge
    parquet-cpp:              1.4.0-h83d4a3d_1                      conda-forge
    parso:                    0.3.1-py_0                            conda-forge
    partd:                    0.3.9-py_0                            conda-forge
    pathos:                   0.2.1-py_2                            conda-forge
    patsy:                    0.5.0-py_1                            conda-forge
    pcre:                     8.41-hfc679d8_3                       conda-forge
    pep8:                     1.7.1-py_0                            conda-forge
    pexpect:                  4.6.0-py36_1000                       conda-forge
    pickleshare:              0.7.5-py36_1000                       conda-forge
    pillow:                   5.3.0-py36hc736899_0                  conda-forge
    pip:                      18.1-py36_1000                        conda-forge
    pixman:                   0.34.0-h470a237_3                     conda-forge
    pluggy:                   0.8.0-py_0                            conda-forge
    ply:                      3.11-py_1                             conda-forge
    pox:                      0.2.3-py_1                            conda-forge
    ppft:                     1.6.4.7.1-py36_1000                   conda-forge
    proj4:                    4.9.3-h470a237_8                      conda-forge
    prometheus_client:        0.4.2-py_0                            conda-forge
    prompt_toolkit:           2.0.6-py_0                            conda-forge
    protobuf:                 3.5.2-py36hd28b015_0                  conda-forge
    psutil:                   5.4.7-py36h470a237_1                  conda-forge
    pthread-stubs:            0.4-h470a237_1                        conda-forge
    ptyprocess:               0.6.0-py36_1000                       conda-forge
    py:                       1.7.0-py_0                            conda-forge
    py4j:                     0.10.7-py_1                           conda-forge
    pyarrow:                  0.9.0-py36hfc679d8_2                  conda-forge
    pycodestyle:              2.4.0-py_1                            conda-forge
    pycparser:                2.19-py_0                             conda-forge
    pyct:                     0.4.5-py_0                            conda-forge
    pyct-core:                0.4.5-py_0                            conda-forge
    pyepsg:                   0.3.2-py_1                            conda-forge
    pyflakes:                 2.0.0-py_0                            conda-forge
    pygments:                 2.2.0-py_1                            conda-forge
    pygpu:                    0.7.6-py36h7eb728f_0                  conda-forge
    pylint:                   2.1.1-py36_0                          conda-forge
    pymc3:                    3.5-py36_0                            conda-forge
    pyopenssl:                18.0.0-py36_1000                      conda-forge
    pyparsing:                2.2.2-py_0                            conda-forge
    pyproj:                   1.9.5.1-py36h508ed2a_5                conda-forge
    pyqt:                     5.6.0-py36h8210e8a_7                  conda-forge
    pyshp:                    1.2.12-py_0                           conda-forge
    pysocks:                  1.6.8-py36_1002                       conda-forge
    pyspark:                  2.3.1-py36_1001                       conda-forge
    pytables:                 3.4.4-py36h4f72b40_1                  conda-forge
    pytest:                   3.9.1-py36_1000                       conda-forge
    python:                   3.6.6-h5001a0f_3                      conda-forge
    python-dateutil:          2.7.3-py_0                            conda-forge
    python-editor:            1.0.3-py_0                            conda-forge
    python-oauth2:            1.0.1-py36_0                          conda-forge
    python-snappy:            0.5.3-py36h00d4201_0                  conda-forge
    pytz:                     2018.5-py_0                           conda-forge
    pyviz_comms:              0.6.0-py_0                            conda-forge
    pywavelets:               1.0.1-py36h7eb728f_0                  conda-forge
    pyyaml:                   3.13-py36h470a237_1                   conda-forge
    pyzmq:                    17.1.2-py36hae99301_1                 conda-forge
    qt:                       5.6.2-hf70d934_9                      conda-forge
    qtawesome:                0.5.1-pyh8a2030e_1                    conda-forge
    qtconsole:                4.4.2-py_1                            conda-forge
    qtpy:                     1.5.1-pyh8a2030e_0                    conda-forge
    readline:                 7.0-haf1bffa_1                        conda-forge
    requests:                 2.19.1-py36_1001                      conda-forge
    rope:                     0.10.7-py_1                           conda-forge
    scikit-image:             0.14.1-py36hfc679d8_0                 conda-forge
    scikit-learn:             0.20.0-py36_blas_openblasha84fab4_201 conda-forge [blas_openblas]
    scipy:                    1.1.0-py36_blas_openblash7943236_201  conda-forge [blas_openblas]
    seaborn:                  0.9.0-py_0                            conda-forge
    secretstorage:            3.1.0-py36_1001                       conda-forge
    send2trash:               1.5.0-py_0                            conda-forge
    setuptools:               40.4.3-py36_0                         conda-forge
    shapely:                  1.6.4-py36h164cb2d_1                  conda-forge
    simplegeneric:            0.8.1-py_1                            conda-forge
    sip:                      4.18.1-py36hfc679d8_0                 conda-forge
    six:                      1.11.0-py36_1001                      conda-forge
    snappy:                   1.1.7-hfc679d8_2                      conda-forge
    snowballstemmer:          1.2.1-py_1                            conda-forge
    sortedcontainers:         2.0.5-py_0                            conda-forge
    sphinx:                   1.8.1-py36_1000                       conda-forge
    sphinxcontrib-websupport: 1.1.0-py_1                            conda-forge
    spyder:                   3.3.1-py36_3                          conda-forge
    spyder-kernels:           0.2.6-py_1                            conda-forge
    sqlalchemy:               1.2.12-py36h470a237_0                 conda-forge
    sqlalchemy-utils:         0.32.12-py36_0                        conda-forge
    sqlite:                   3.25.2-hb1c47c0_0                     conda-forge
    statsmodels:              0.9.0-py36h7eb728f_0                  conda-forge
    sudospawner:              0.5.2-py36_0                          conda-forge
    sympy:                    1.3-py36_1000                         conda-forge
    tblib:                    1.3.2-py_1                            conda-forge
    terminado:                0.8.1-py36_1001                       conda-forge
    testpath:                 0.4.2-py36_1000                       conda-forge
    theano:                   1.0.3-py36_0                          conda-forge
    thrift:                   0.11.0-py36hfc679d8_1                 conda-forge
    thriftpy:                 0.3.9-py36h470a237_1                  conda-forge
    tk:                       8.6.8-ha92aebf_0                      conda-forge
    toolz:                    0.9.0-py_1                            conda-forge
    tornado:                  5.1.1-py36h470a237_0                  conda-forge
    tqdm:                     4.26.0-py_0                           conda-forge
    traitlets:                4.3.2-py36_1000                       conda-forge
    typed-ast:                1.1.0-py36_0                          conda-forge
    uncertainties:            3.0.2-py36_1001                       conda-forge
    urllib3:                  1.23-py36_1001                        conda-forge
    wcwidth:                  0.1.7-py_1                            conda-forge
    webencodings:             0.5.1-py_1                            conda-forge
    werkzeug:                 0.14.1-py_0                           conda-forge
    wheel:                    0.32.1-py36_0                         conda-forge
    widgetsnbextension:       3.4.2-py36_1000                       conda-forge
    wrapt:                    1.10.11-py36h470a237_1                conda-forge
    xarray:                   0.10.9-py36_0                         conda-forge
    xorg-kbproto:             1.0.7-h470a237_2                      conda-forge
    xorg-libice:              1.0.9-h470a237_4                      conda-forge
    xorg-libsm:               1.2.3-h8c8a85c_0                      conda-forge
    xorg-libx11:              1.6.6-h470a237_0                      conda-forge
    xorg-libxau:              1.0.8-h470a237_6                      conda-forge
    xorg-libxdmcp:            1.1.2-h470a237_7                      conda-forge
    xorg-libxext:             1.3.3-h470a237_4                      conda-forge
    xorg-libxpm:              3.5.12-h470a237_2                     conda-forge
    xorg-libxrender:          0.9.10-h470a237_2                     conda-forge
    xorg-libxt:               1.1.5-h470a237_2                      conda-forge
    xorg-renderproto:         0.11.1-h470a237_2                     conda-forge
    xorg-xextproto:           7.3.0-h470a237_2                      conda-forge
    xorg-xproto:              7.0.31-h470a237_7                     conda-forge
    xz:                       5.2.4-h470a237_1                      conda-forge
    yaml:                     0.1.7-h470a237_1                      conda-forge
    zeromq:                   4.2.5-hfc679d8_6                      conda-forge
    zict:                     0.1.3-py_0                            conda-forge
    zlib:                     1.2.11-h470a237_3                     conda-forge

Proceed ([y]/n)? 


Downloading and Extracting Packages
flask-1.0.2          | 66 KB     | ######################################################### | 100% 
pylint-2.1.1         | 794 KB    | ######################################################### | 100% 
libgpg-error-1.32    | 241 KB    | ######################################################### | 100% 
futures-compat-1.0   | 313 B     | ######################################################### | 100% 
wrapt-1.10.11        | 74 KB     | ######################################################### | 100% 
secretstorage-3.1.0  | 22 KB     | ######################################################### | 100% 
jsonschema-2.6.0     | 62 KB     | ######################################################### | 100% 
param-1.8.1          | 55 KB     | ######################################################### | 100% 
blas-1.1             | 1 KB      | ######################################################### | 100% 
libssh2-1.8.0        | 240 KB    | ######################################################### | 100% 
readline-7.0         | 381 KB    | ######################################################### | 100% 
cloudpickle-0.6.1    | 16 KB     | ######################################################### | 100% 
geographiclib-1.49   | 32 KB     | ######################################################### | 100% 
h5py-2.8.0           | 3.7 MB    | ######################################################### | 100% 
flask-cors-3.0.6     | 13 KB     | ######################################################### | 100% 
pox-0.2.3            | 18 KB     | ######################################################### | 100% 
beautifulsoup4-4.6.3 | 141 KB    | ######################################################### | 100% 
tk-8.6.8             | 3.1 MB    | ######################################################### | 100% 
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sip-4.18.1           | 266 KB    | ######################################################### | 100% 
webencodings-0.5.1   | 12 KB     | ######################################################### | 100% 
ptyprocess-0.6.0     | 22 KB     | ######################################################### | 100% 
nodejs-8.10.0        | 14.9 MB   | ######################################################### | 100% 
tornado-5.1.1        | 669 KB    | ######################################################### | 100% 
multipledispatch-0.6 | 12 KB     | ######################################################### | 100% 
bokeh-0.13.0         | 5.8 MB    | ######################################################### | 100% 
libgpuarray-0.7.6    | 240 KB    | ######################################################### | 100% 
pyarrow-0.9.0        | 1.2 MB    | ######################################################### | 100% 
impyla-0.14.1        | 88 KB     | ######################################################### | 100% 
datashader-0.6.8     | 10.8 MB   | ######################################################### | 100% 
libgfortran-3.0.0    | 281 KB    | ######################################################### | 100% 
cython-0.29          | 4.9 MB    | ######################################################### | 100% 
py4j-0.10.7          | 177 KB    | ######################################################### | 100% 
sympy-1.3            | 9.4 MB    | ######################################################### | 100% 
pycodestyle-2.4.0    | 34 KB     | ######################################################### | 100% 
xz-5.2.4             | 328 KB    | ######################################################### | 100% 
sqlite-3.25.2        | 1.6 MB    | ######################################################### | 100% 
arrow-cpp-0.9.0      | 4.2 MB    | ######################################################### | 100% 
harfbuzz-1.9.0       | 1.1 MB    | ######################################################### | 100% 
pexpect-4.6.0        | 75 KB     | ######################################################### | 100% 
xorg-renderproto-0.1 | 8 KB      | ######################################################### | 100% 
sqlalchemy-1.2.12    | 1.6 MB    | ######################################################### | 100% 
dbus-1.13.0          | 560 KB    | ######################################################### | 100% 
babel-2.6.0          | 5.6 MB    | ######################################################### | 100% 
testpath-0.4.2       | 91 KB     | ######################################################### | 100% 
xorg-libxext-1.3.3   | 45 KB     | ######################################################### | 100% 
h5netcdf-0.6.2       | 15 KB     | ######################################################### | 100% 
widgetsnbextension-3 | 1.7 MB    | ######################################################### | 100% 
cairo-1.14.12        | 1.3 MB    | ######################################################### | 100% 
qtpy-1.5.1           | 28 KB     | ######################################################### | 100% 
pyct-core-0.4.5      | 11 KB     | ######################################################### | 100% 
pytables-3.4.4       | 8.3 MB    | ######################################################### | 100% 
pyshp-1.2.12         | 22 KB     | ######################################################### | 100% 
pamela-0.3.0         | 8 KB      | ######################################################### | 100% 
owslib-0.17.0        | 117 KB    | ######################################################### | 100% 
bitarray-0.8.3       | 113 KB    | ######################################################### | 100% 
parso-0.3.1          | 59 KB     | ######################################################### | 100% 
libpng-1.6.35        | 305 KB    | ######################################################### | 100% 
pickleshare-0.7.5    | 12 KB     | ######################################################### | 100% 
graphviz-2.38.0      | 9.7 MB    | ######################################################### | 100% 
sqlalchemy-utils-0.3 | 104 KB    | ######################################################### | 100% 
jpeg-9c              | 229 KB    | ######################################################### | 100% 
imagesize-1.1.0      | 6 KB      | ######################################################### | 100% 
joblib-0.12.5        | 176 KB    | ######################################################### | 100% 
jupyter-1.0.0        | 6 KB      | ######################################################### | 100% 
colorcet-1.0.0       | 109 KB    | ######################################################### | 100% 
curl-7.61.0          | 859 KB    | ######################################################### | 100% 
gstreamer-1.12.5     | 2.1 MB    | ######################################################### | 100% 
libgsasl-1.8.0       | 125 KB    | ######################################################### | 100% 
itsdangerous-0.24    | 12 KB     | ######################################################### | 100% 
chardet-3.0.4        | 190 KB    | ######################################################### | 100% 
psutil-5.4.7         | 333 KB    | ######################################################### | 100% 
uncertainties-3.0.2  | 117 KB    | ######################################################### | 100% 
pytz-2018.5          | 193 KB    | ######################################################### | 100% 
sudospawner-0.5.2    | 13 KB     | ######################################################### | 100% 
libsodium-1.0.16     | 536 KB    | ######################################################### | 100% 
xorg-libxrender-0.9. | 28 KB     | ######################################################### | 100% 
nbformat-4.4.0       | 91 KB     | ######################################################### | 100% 
dill-0.2.8.2         | 111 KB    | ######################################################### | 100% 
mpc-1.1.0            | 125 KB    | ######################################################### | 100% 
findspark-1.3.0      | 6 KB      | ######################################################### | 100% 
python-oauth2-1.0.1  | 86 KB     | ######################################################### | 100% 
geopy-1.17.0         | 49 KB     | ######################################################### | 100% 
certifi-2018.10.15   | 138 KB    | ######################################################### | 100% 
six-1.11.0           | 21 KB     | ######################################################### | 100% 
zeromq-4.2.5         | 939 KB    | ######################################################### | 100% 
backcall-0.1.0       | 13 KB     | ######################################################### | 100% 
graphite2-1.3.12     | 104 KB    | ######################################################### | 100% 
xorg-xproto-7.0.31   | 72 KB     | ######################################################### | 100% 
pthread-stubs-0.4    | 5 KB      | ######################################################### | 100% 
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: \ Enabling notebook extension jupyter-js-widgets/extension...
      - Validating: OK

done
#
# To activate this environment, use
#
#     $ conda activate testenv
#
# To deactivate an active environment, use
#
#     $ conda deactivate

$ source /opt/anaconda3/bin/activate testenv
(testenv) $ python
Python 3.6.6 | packaged by conda-forge | (default, Oct 12 2018, 14:08:43) 
[GCC 4.8.2 20140120 (Red Hat 4.8.2-15)] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import pyarrow
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/opt/anaconda3/envs/testenv/lib/python3.6/site-packages/pyarrow/__init__.py", line 47, in <module>
    from pyarrow.lib import cpu_count, set_cpu_count
ImportError: libboost_regex.so.1.65.1: cannot open shared object file: No such file or directory
>>> 

Thanks again.

[wesm]

If you conda remove libboost what happens?

[wesm]

Ah I see you don't have libboost at all

This is problematic

pyarrow:                  0.9.0-py36hfc679d8_2                  conda-forge

What happens when you install pyarrow 0.11.0?

[rstuckey]

Yep, I think that's it. Looks like libhdfs3 was restricting boost:

(testenv) $ /opt/anaconda3/bin/conda install --channel conda-forge --override-channels pyarrow=0.11.0
Solving environment: failed

UnsatisfiableError: The following specifications were found to be in conflict:
  - libhdfs3 -> boost-cpp=1.64
  - pyarrow=0.11.0 -> arrow-cpp=0.11.0 -> boost-cpp[version='>=1.67.0,<1.67.1.0a0']
  - pyarrow=0.11.0 -> arrow-cpp=0.11.0 -> numpy[version='>=1.14,<2.0a0']
Use "conda info <package>" to see the dependencies for each package.

(testenv) $ /opt/anaconda3/bin/conda uninstall hdfs3
Solving environment: done

## Package Plan ##

  environment location: /opt/anaconda3/envs/testenv

  removed specs: 
    - hdfs3

The following packages will be REMOVED:

    hdfs3: 0.3.0-py36_0 conda-forge

Proceed ([y]/n)? 

Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
(testenv) $ /opt/anaconda3/bin/conda install --channel conda-forge --override-channels pyarrow=0.11.0
Solving environment: done

## Package Plan ##

  environment location: /opt/anaconda3/envs/testenv

  added / updated specs: 
    - pyarrow=0.11.0


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    boost-cpp-1.67.0           |       h3a22d5f_0        19.7 MB  conda-forge
    boost-1.67.0               |   py36h3e44d54_0         316 KB  conda-forge
    pyarrow-0.11.0             |   py36hfc679d8_0         2.0 MB  conda-forge
    parquet-cpp-1.2.0.pre      |                0         1.6 MB  conda-forge
    arrow-cpp-0.11.0           |   py36hccec0d8_0         6.1 MB  conda-forge
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:        29.7 MB

The following packages will be REMOVED:

    libhdfs3:    2.3-3                conda-forge

The following packages will be UPDATED:

    arrow-cpp:   0.9.0-py36h1ae9da6_7 conda-forge --> 0.11.0-py36hccec0d8_0 conda-forge
    boost:       1.66.0-py36_1        conda-forge --> 1.67.0-py36h3e44d54_0 conda-forge
    boost-cpp:   1.66.0-1             conda-forge --> 1.67.0-h3a22d5f_0     conda-forge
    pyarrow:     0.9.0-py36hfc679d8_2 conda-forge --> 0.11.0-py36hfc679d8_0 conda-forge

The following packages will be DOWNGRADED:

    parquet-cpp: 1.4.0-h83d4a3d_1     conda-forge --> 1.2.0.pre-0           conda-forge

Proceed ([y]/n)? 


Downloading and Extracting Packages
boost-cpp-1.67.0     | 19.7 MB   | ######################################################### | 100% 
boost-1.67.0         | 316 KB    | ######################################################### | 100% 
pyarrow-0.11.0       | 2.0 MB    | ######################################################### | 100% 
parquet-cpp-1.2.0.pr | 1.6 MB    | ######################################################### | 100% 
arrow-cpp-0.11.0     | 6.1 MB    | ######################################################### | 100% 
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
(testenv) $ python
Python 3.6.6 | packaged by conda-forge | (default, Oct 12 2018, 14:08:43) 
[GCC 4.8.2 20140120 (Red Hat 4.8.2-15)] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import pyarrow
>>> 

Thanks again!

[wesm]

Thanks -- feel free to open an issue on conda-forge/libhdfs3-feedstock about bringing the project up to date with the latest package stack

@kszucs the parquet-cpp version installed here looks weird, do you know what is going on?